上赛季开始前，新疆队通过顶薪独家签约权锁定了周琦，但周琦不同意续约，双方最终未能达成协议，周琦前往凤凰队效力。据周琦当时的团队介绍，选择凤凰队的一个重要原因是对方充满诚意，俱乐部管理层和主教练都做出了相应的承诺。凤凰队将以周琦为核心，打造涉及技战术的阵容。上赛季，周琦在凤凰队场均得到11.6分，抢下6.6个篮板，整体表现与数据尚可，但在多场比赛的重要时刻，周琦却未能出战。上赛季结束后，据《北京青年报》报道，凤凰队曾向周琦签订过丰厚的续约合同，但周琦当时并没有选择续约。

上赛季结束后，周琦回到了中国男子篮球队，他代表球队参加了世界预赛和亚洲杯。周琦在代表中国男子篮球队时表现出色，他的进步是显而易见的。周琦还在一次采访中说，通过上赛季在澳大利亚联赛的经验，他更适应了高强度的对抗环境。

在为中国男子篮球队效力后，周琦回到了中国，他利用这段时间陪家人。不久前，在新赛季国内球员（国家队）注册截止日期，新疆队没有提交周琦的注册材料，这意味着他又错过了CBA。此后，周琦的经纪团队明确表示，周琦将继续为海外联赛效力。